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甲減的原因主要分為以下幾大類：
第一、手術導致的甲減，有些人因為得了甲狀腺腫或者甲亢，于是進行了外科手術，術后可能是因為甲狀腺組織破壞得過多，可以導致術后的甲減。
第二、同位素治療導致的甲減，因為甲亢有一種治療方法之一，就是放射性碘-131治療，放射性碘-131治療，也是應用同位素來破壞甲狀腺細胞，最終可能還會導致永久性的甲減。
第三、垂體的原因，也就是中樞性甲減，比如垂體長了瘤或者空泡蝶鞍等原因，導致中樞性甲減。
第四、最常見的原因，如自身免疫性的原因導致甲減，是因為甲狀腺的破壞，而導致的甲減。