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丙肝病毒的潛伏期是2周～6個(gè)月，平均40天。丙型肝炎在感染第一周即可從血液或感組織中用PCR法檢出丙肝病毒。第2周開始，可檢出丙肝抗體。少部分病例感染3個(gè)月后才檢測到丙肝抗體。丙肝感染后易慢性化，超過50%的丙肝感染者轉(zhuǎn)為慢性。血漿中的丙肝濃度約為10的2次方到10的8次方。丙型肝炎病毒RNA陽性是病毒感染和復(fù)制的直接標(biāo)志。