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偽膜性腸炎患者大便的最主要特征就是腹瀉，且大便不成形，腹瀉物呈綠色海水樣或者黃色蛋花樣，多在使用抗生素的4-10天內發(fā)生，或者在停止使用抗生素后的1-2周內發(fā)生，也可于手術后的5-20天內發(fā)生。本病腹瀉的程度和次數不一，輕型病例大便每日2-3次，可以在停止使用抗生素后自愈。重型病例有大量的腹瀉，每日可達30余次之多，有時候腹瀉可以持續(xù)4-5周，少數病例可以排出斑塊狀假膜，血糞少見，腹瀉后腹脹可以減輕。
由于大量的腹瀉，可以導致出現毒血癥，具體表現為心動過速、發(fā)熱、譫妄以及定向功能障礙，重者可以發(fā)生低血壓休克、嚴重的脫水、電解質失衡、代謝性酸中毒、少尿，甚至急性腎功能不全，以致危及生命。大便常規(guī)檢查可以見到紅細胞、白細胞，糞便細菌學分離鑒定有難辨梭狀芽孢桿菌，有助于診斷。