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真菌性腦膜炎往往是亞急性起病，也可是慢性起病，2周以上就會出現(xiàn)典型的腦膜炎癥狀，如頭痛、惡心、視物模糊等，甚至于出現(xiàn)癲癇、抽搐表現(xiàn)。根據(jù)真菌的致病性不同，其臨床表現(xiàn)也輕緩不同。如較常見的隱球菌腦膜炎導(dǎo)致的癥狀相對較輕，經(jīng)過正規(guī)治療，大部分患者都可徹底治愈。

但是曲霉菌引起的顱內(nèi)病變，其病情進展較快，抗曲霉菌治療的藥物，如棘白菌素類、伏立康唑，這些藥物都可起到較好療效。