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引起生殖器皰疹的病毒主要有單純皰疹病毒Ⅰ型和單純皰疹病毒Ⅱ型，單純皰疹病毒Ⅰ型是口唇部皰疹的主要病因，口交行為是生殖器皰疹的常見(jiàn)誘因之一。

在肛門生殖器皰疹中，單純皰疹病毒Ⅰ型的感染力比之前升高，在男男同性戀及女女同性戀中發(fā)現(xiàn)的比較多。單純皰疹病毒Ⅱ型是生殖器皰疹發(fā)作最常見(jiàn)和最主要的原因，是亞臨床癥狀及無(wú)癥狀排毒期間間歇性排毒的主要病因。目前生殖器皰疹Ⅰ型和Ⅱ型均可誘發(fā)患者病情反復(fù)發(fā)作，但病情復(fù)發(fā)在Ⅱ型皰疹病毒中更為常見(jiàn)，皰疹病毒的分型有利于患者病情評(píng)估和預(yù)后估測(cè)。

目前對(duì)皰疹病毒的檢測(cè)有兩種手段，一種是病毒學(xué)檢測(cè)，即對(duì)皮病損處的組織和細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng)，但是因?yàn)闄z測(cè)率靈敏度較低，臨床上多采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)即PCR反應(yīng)，生殖器皰疹為間歇性排毒，所以PCR檢測(cè)結(jié)果陰性并不能排除沒(méi)有皰疹病毒的感染。血清學(xué)檢測(cè)是血清學(xué)皰疹病毒抗體檢測(cè)，主要用于臨床上無(wú)癥狀的HSV感染的監(jiān)測(cè)。