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胃腸間質(zhì)瘤診斷明確以后如果能夠手術(shù)，盡量手術(shù)完整切除，達到R0切除，即盡量把腫瘤切干凈。手術(shù)后根據(jù)危險度分級，決定需不需要藥物輔助治療。因此在治療過程中或者手術(shù)以后，即使不需要藥物治療，患者要隨訪檢查。一般隨訪檢查的項目有血常規(guī)、血液生化檢查，另外最重要的是做腹部相關(guān)的檢查，例如腹部CT或者腹部超聲檢查。

因為間質(zhì)瘤如果復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移，最常見的是腹腔內(nèi)或者肝臟轉(zhuǎn)移。因此CT和超聲的檢查在隨訪過程中容易發(fā)現(xiàn)早期的復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移，對患者的復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移進一步治療有很大幫助，常用的檢查是CT或者腹部超聲。

另外比如PET-CT或者磁共振也可以作為術(shù)后的輔助檢查，但是因為價格問題，最常用的是CT或者超聲檢查。