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確診為運動神經(jīng)元病的患者預后通常不好。伴隨著病情延長，多數(shù)患者在發(fā)病后的3-5年可死于呼吸功能衰竭以及呼吸系統(tǒng)相關的并發(fā)癥。少數(shù)患者可在伴有終身殘疾的情況下存活較長時間，而有較好醫(yī)療條件支持和家庭支持的患者生存期可以得到一定的延長。常規(guī)的肌萎縮側索硬化癥或者運動神經(jīng)元病不存在自愈表現(xiàn)，但是有時可以看到肌萎縮側索硬化癥治愈的新聞，其實更可能是類ALS綜合征的治愈，即類似肌萎縮側索硬化的臨床癥狀得到改善。
在臨床上，診斷運動神經(jīng)元病需要注意篩查是否存在于腫瘤、甲亢、風濕性免疫病等誘發(fā)類肌萎縮側索硬化綜合征的疾病。類肌萎縮側索硬化綜合征與肌萎縮側索硬化癥的治療不同，應以控制病因為主。臨床上曾經(jīng)有患者前來就診時，表現(xiàn)為典型的肌萎縮側索硬化癥狀，隨訪半年后發(fā)現(xiàn)該患者風濕免疫性疾病的相關指標明顯增高。后來按照風濕治療，各項指標恢復正常，11年內(nèi)肌萎縮側索硬化的癥狀并沒有再次發(fā)展。此病例中肌萎縮側索硬化與風濕免疫病的同時出現(xiàn)，較難稱為只是巧合。所以一定要鑒別是原發(fā)性的、還是繼發(fā)性的肌萎縮側索硬化性疾病。