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結(jié)核性腦膜炎腦脊液是清亮的，但多數(shù)情況下稍渾濁，呈毛玻璃樣。結(jié)核性腦脊液早期改變，是診斷結(jié)核性腦膜炎的重要依據(jù)之一。結(jié)核性腦膜炎腦脊液的壓力通常在200mmH2O以上，細(xì)胞數(shù)在300-500×10^6/L，部分也超過1000×10^6/L，白細(xì)胞計(jì)數(shù)以淋巴細(xì)胞為主，早期是多核多進(jìn)，后期是單核多進(jìn)。

腦脊液的生化改變，典型改變是低氯、低糖、高蛋白，糖一般低于2.8mmol/L或低于同期所測(cè)血糖的45%。氯化物的改變比糖更敏感，通常在120mmol/L以下，蛋白通常大于450mg/L,部分結(jié)核性腦膜炎、蛛網(wǎng)膜下腔粘連的蛋白可達(dá)10g/L。結(jié)核性腦膜炎、腦脊液內(nèi)腺苷脫氨酶和γ-干擾素也有增高，核酸檢測(cè)可能陽(yáng)性。結(jié)核桿菌和結(jié)核培養(yǎng)陽(yáng)性率較低，抗酸桿菌通常陽(yáng)性率是10%-15%，培養(yǎng)的陽(yáng)性率是20%-30%。