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幽門螺桿菌檢查的方法，臨床上常用的有兩種：
第一種方法是侵入性的檢查方法，就是通過胃鏡，采取胃黏膜的活檢進行檢測，包括快速的尿素酶試驗、組織學(xué)檢查和幽門螺桿菌的培養(yǎng)。這種方法是需要在胃鏡的幫助下進行，一般來說費用較高，陽率較低。
第二種方法是非侵入性的幽門螺桿菌檢測，常用的有碳13和碳14呼氣試驗，碳13呼氣試驗適用于孕婦和幼兒，對于未婚或者是小孩必須采用碳13，而不用碳14。
根據(jù)當?shù)氐臈l件或者是技術(shù)水平，可以采用快速尿素酶試驗，這種方法操作起來比較簡單，費用較低，但是陽率誤差較大，碳13和碳14是臨床上最常用的方法。