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肺部的腫瘤標記物應該查的項目有很多，其中包括蛋白質、內分泌物質、酶、肽類和各種抗原物質。
應用相關抗原如CEA、Cyfra21-1、NSE及可溶性膜抗原，某些酶如α1-抗胰蛋白酶（AAT）、胎盤堿性磷酸酶（PAKP）、淀粉酶、芳香烴羥化酶（AHH）、唾液酸、磷酸己糖異構酶（PHI）、乳酸脫氫酶的同工酶（LDH5、LDH3）以及谷胱甘肽S-轉移酶等，作為觀察病情變化的參考指標。