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正常情況下的骨骼，在核磁共振下無論是T1加權像，還是T2加權像，骨皮質(zhì)都是低信號，而骨髓只在T1加權像上是高信號，在T2加權像上是中等信號。一旦患者的骨頭顯示為白色，要考慮是否有炎癥或者腫瘤等相關的疾病。
核磁共振對于軟組織的分辨率比較高，所以更適合于觀察關節(jié)周圍的軟組織，例如肌肉、血管，以及神經(jīng)等。對于骨皮質(zhì)的病變顯示的相對比較差，所以有一些疾病通常需要患者做相應骨骼CT檢查，以及核磁共振檢查來綜合判斷病變的具體情況。