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鼻咽癌常用核磁共振檢查，一般在核磁共振T1加權像上，鼻咽部的腫瘤和纖維化組織呈低信號，在T2加權像上腫瘤多為高信號，纖維化組織呈低信號。磁共振檢查可以確定鼻咽癌的部位、范圍，以及鄰近部位的侵犯情況。
對于放化療后復發(fā)的鼻咽癌，核磁共振有獨到的作用，可以鑒別放療后組織纖維化和復發(fā)的腫瘤，一般復發(fā)的腫瘤呈不規(guī)則的團塊狀，同時伴有鄰近骨、軟組織結構的侵犯，以及淋巴結腫大，放療后纖維化呈局限性增厚的腫塊，或者局限性不規(guī)則的斑片狀結構，與鄰近組織分界不清。鼻咽癌核磁共振檢查的優(yōu)勢在于，對鼻咽癌周圍軟組織受侵犯的檢出率達35%，顱骨骨折可以達到20%，顱內檢出率達到17%，對咽旁間隙檢出率達17%。多項研究表明，核磁共振可以使30%以上的臨床分期發(fā)生改變，所以鼻咽癌的核磁共振檢查很重要，盡量選擇核磁共振檢查鼻咽癌。