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結膜炎是眼科最常見的疾病之一，其致病原因可以分為微生物性和非微生物性兩大類，根據不同來源可分為外源性和內源性，也可因鄰近的組織炎癥蔓延感染所引起。結膜炎最常見的原因是微生物感染，致病微生物可以為細菌，例如肺炎球菌、流感嗜血桿菌、金黃色葡萄球菌、淋球菌等，病毒如單純皰疹病毒，或衣原體，偶見真菌和立克次氏體和寄生蟲感染。
物理刺激因素包括如風沙、粉塵、紫外線等，除此之外化學性損傷也可以引起結膜炎，例如醫(yī)用藥物、酸、堿或者有毒氣體等。此外部分結膜炎是由免疫病變所引起，例如外界的粉塵、顆粒、動物皮毛等。