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腦膜炎是覆蓋腦和脊髓的保護膜的急性炎癥，腦膜炎可能由于病毒、細菌、真菌或其他微生物感染引起，而某些藥物等原因導致的無菌性腦膜炎則少見。
腦膜炎通常由微生物引起，大多數感染由病毒引起，細菌、真菌和原生動物是常見的原因。也可能是由于各種非感染性原因引起，比如無菌性腦膜炎，心臟瓣膜的感染可能導致無菌性腦膜炎。
無菌性腦膜炎也可能由于梅毒螺旋體或伯氏疏螺旋體等引起，與淡水來源有關的腦膜炎可由變形蟲感染而引起。細菌性腦膜炎的致病菌包括肺炎鏈球菌、大腸桿菌、單核細胞增生李斯特菌、腦膜炎雙球菌。
顱骨創(chuàng)傷可能使鼻腔細菌進入腦膜腔，而腦內的某些分流裝置可能增加腦膜炎風險，在這種情況下更容易感染葡萄球菌、假單胞菌和革蘭陰性細菌。
頭頸部的感染如中耳炎或乳突炎可導致一部分人患腦膜炎，聽力損害的人工耳蝸植入者更容易患肺炎球菌腦膜炎。
結核性腦膜炎是由于結核分枝桿菌而引起的腦膜炎，引起腦膜炎的病毒包括腸道病毒、單純皰疹病毒、水痘-帶狀皰疹病毒、腮腺炎病毒、艾滋病病毒和巨細胞病毒等。
真菌性腦膜炎有許多危險因素包括使用免疫抑制劑、器官移植、艾滋病毒感染、與衰老有關的免疫力喪失，最常見的真菌性腦膜炎是由于新型隱球菌感染引起的，其他組織胞漿菌、皮膚芽胞桿菌和念珠菌也可以引起真菌性腦膜炎。
引起腦膜炎的寄生蟲感染包括廣州管圓線蟲、血吸蟲、囊尾蚴病等寄生蟲。非感染性原因可能是癌癥擴散到腦膜或者某些非甾體類抗炎藥、抗生素、丙種球蛋白等引起，風濕免疫系統疾病、系統性紅斑狼瘡和白塞病也可以引起非感染性腦膜炎。