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腦彩超主要是指利用超聲對胎兒，或者是嬰幼兒顱腦進行檢查的一種方式，由于成人顱骨厚度比較大，超聲很難穿透，故一般不會用超聲對成人腦部進行檢查。嬰幼兒由于此時囟門還沒有閉合，可以以前囟作為透聲窗，對顱腦內的組織進行觀察，腦部彩超可以觀察到是否有腦積水，以及早產兒是否有顱內出血等。
由于超聲檢查比較簡單方便，可以在床頭進行，對于部分嬰幼兒可實時的進行觀察。所以，在胎兒顱腦疾病方面應用比較多，有的時候超聲也能夠判斷一些嬰幼兒的顱內腫瘤。所以，腦彩超在臨床上主要用于以上幾方面。腦積水超聲檢查是首選的方法，再就是早產兒的顱內出血，一般也會選擇用超聲進行檢查，不但可以判斷是否有出血，還可以對出血進行分級。