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人感染禽流感的原因主要是人直接或間接感染禽流感病毒，目前可將甲型流感病毒分為9種N亞型、16種H亞型，病毒在哺乳類動物、家禽、人類之間傳播。機體免疫力低下的人群更易感。
人感染禽流感是由禽甲型流感病毒某些亞型中的一些毒株引起，其中的H5N1亞型可引起高致病性禽流感。禽流感病毒可在家禽流行，與多個病毒頻繁重排，增加了基因重排的可能；基因含有多個突變位點，增加了對人宿主細胞唾液酸受體的辨識度，增強其對人的感染能力。